Ο Σ.Ε.Ι και η Κ.Σ.Ε διατηρούν άριστες σχέσεις και συνεργάζονται σε θέματα που αφορούν την κυνηγετική παιδεία και πολιτισμό, την διαχείριση των πληθυσμών θηραμάτων και την πάταξη της λαθροθηρίας.
Υποχρεωτικά όλα τα μέλη του Σ.Ε.Ι πρέπει να έχουν εκδώσει άδεια θήρας προτού αποκτήσουν Άδεια Χειριστή Θηρευτικού Αρπακτικού Πτηνού.
Παράλληλα η Ομοσπονδιακή Θηροφυλάκη και ο Σ.Ε.Ι συνεργάζονται τόσο στην διάσωση και προστασία των αρπακτικών πτηνών όσο και σε θέματα πάταξης της λαθροθηρίας.